Formado en las categorías inferiores del Espanyol, Carlos Clerc llegó a debutar en el primer equipo blanquiazul en 2013. En el mercado de invierno de 2014 fue cedido al CE Sabadell, permaneciendo temporada y media en la entidad arlequinada. La temporada siguiente marchó también cedido al Girona FC. A finales de agosto de 2016, tras hacer la pretemporada con el Espanyol, rescindió contrato para fichar por Osasuna En verano de 2019 firmó por el Levante y al acabar contrato se vinculó por dos temporada al club de la franja verde. Carlos Clerc es uno de los fijos en la defensa del técnico del Elche Sebastián Beccacece, que últimamente ha optado por situarlo como central.
